2017年2月，某平行世界。
这里没有季星，圣杯也没有在第三次圣杯大战中被污染，历史自1950年现象记录电脑使魔·拉普拉斯的发明更走上了另一个拐点。
在2004年的圣杯战争中，马里斯比利借用所罗门王的力量轻松取得胜利，向圣杯许愿了财富，获得了将早已筹建的‘人理存续保障机构菲尼斯·迦勒底’壮大的金钱。
迦勒底是一个能够不被任何国家干涉、且能守护住秘密地点的魔术工坊，也是一个能从虚空俯瞰地球一切秘密的天文台。
这也是防止人类灭绝，各国共同建立的特务机构，不分魔术、科学，聚集了各领域的研究者的研究所，观测这个仅靠魔术无法窥全貌而仅靠科学又无法衡全盘的世界。
在2016年中，这个世界发生了名为‘人理烧却’的恶性灾难，而人理便是指人类在本世界的起源、存在、发展的概念，一旦被烧毁，人类种将被根源性地灭绝。
好在在这个世界最后一名御主藤丸立香和迦勒底制造出来的融合了英灵的亚从者玛修·基列莱特的努力下，其它全体成员的帮助下，他们修复了八大特异点、人理的引爆点，并最终击败了引导了这一切发生的第一兽魔神王盖提亚。
解决了人理烧却的灾难。
在这段旅程中，他们收获了很多，也失去了很多，即使时间已过去了一个多月，每每回想起旅途的波澜，也仍会心潮起伏不定。
站在三层防寒玻璃窗前，望着窗外的大雪皑皑，藤丸立香突然不易察觉地轻轻一叹。
这被身边少女敏锐注意到，声音轻柔问：“想家了吗？前辈。”
“啊……啊？”藤丸立香意外转头：“怎么会这么问？玛修。”
“我记得今天晚上……在前辈的国家里叫‘冬之夜’，是一个团圆的日子吧？”玛修问。
“……是啊，冬之夜！”藤丸立香一拍手掌，笑道：“不是玛修提醒，我都完全没有想起来呢，迦勒底这边每天都在下着大雪。不过想家倒是没有，而且冬之夜……”
“藤丸！玛修！！”
话至中途，突然被急促的喊声打断，一个生有柔顺黑发的知性少女正快速跑向他们。
“达·芬奇桑？”
“发生了什么事吗？”
这正是文艺复兴三杰的那个达·芬奇，因为追求美丽，而蒙娜丽莎在她心中是最美丽的，于是在回应召唤时用了些手段变成了这样。
跑到二人近处，她粗喘了两口气，语气激动道：“刚刚我在收拾罗马尼房间的时候，发现了一份之前没有看到过的录像，可能……”
藤丸立香和玛修神色一变，立刻懂了，随达·芬奇一起跑离。
罗马尼·阿基曼，此前担任迦勒底的医生，又在所长身故后代理过半年的所长，是他们信任、并永远不会忘记的同伴之一。
其真实身份乃是所罗门！
这个世界的所罗门王在赢得圣杯战争后，和马里斯比利一样向圣杯许愿，愿望是‘成为人类’。
他拥有了人类的喜怒哀乐，拥有了一切情感，在迦勒底勤勤恳恳地工作了11年时间，但就在一个多月前，为了击败诞生于他尸骸中的怜悯之兽盖提亚，罗马尼阿基曼还戒于天，已经彻底消逝。
就连英灵座上都不再存在所罗门王，所有平行世界都不再具备召唤他的可能，他通过另外一种方式如觉者一般超脱了出去。
留给友人们的自然只有思念。
没想到时隔一个多月，早已清理过几遍的他的遗物中还有新的发现，甚至是一盘录像？那里面会有什么？……遗言吗？
“达·芬奇桑没有先看吗？”
“没有，发现了录像我就立刻去找你们两个了。”
达·芬奇轻轻摇头，三人已经怀有紧张地站到一块屏幕前。
随着录像的读取，沙地一声响动后，画面出现。身穿白大褂、米色头发低垂的温和青年出现在电视中，正是罗马尼·阿基曼！
“医生……”再看到那温和的笑脸，玛修的眼睛有些泛红。
藤丸立香亦感觉难过，不过认真地等待着罗马尼的留言。
“藤丸，玛修，达·芬奇，你们都在吧？”电视里的青年仿佛能看到外面，开口道：“如果还有其他人在场的话，能不能先回避一下呢？啊，不是不信任大家，只是接下来要说的是一些‘私事’，哈哈哈，还是不希望太多人知道啦。”
停顿了十秒钟，他才继续道：“当你们看到这份录像时，我应该已经离开一段时间了吧？真的非常抱歉，我可能……在死后还给大家留下了一个大麻烦。”
藤丸立香三人对视，不是私事吗？什么麻烦？
“在留下这份录像前，我其实犹豫了很久很久，并且几度想要将它销毁，但最终……总还是无法完全无视曾经的‘过错’。在我的手中，曾经有一个世界走向毁灭。”
世界……毁灭？！
“那是与迦勒底所在世界发展有许多不同的平行世界，冬木市的第五次圣杯战争演变成了7vs7的圣杯大战，我同样作为从者被马里斯比利召唤，但实质上，真正把我召唤过去的是抑制力阿赖耶。”
“其目的是对抗一个不知如何锁定了那边世界，并两度派遣分身入侵的异星神灵——季星。”
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异星神？抑制力……对抗？
这重大的消息让经历过人理烧却灾难的三人心中一紧，只听这部分，就知道那边的情况很严峻。
接下来，从罗马尼·阿基曼的口中，他们得知了另一个世界的发展，直到所罗门王裁断世界，将那个平行世界带向了毁灭！